В мире шиноби грядут трудные времена, мир на гране войны, за сферы влияния различных деревень и организаций. Гармонии нет негде и не в чём, даже в такой организации как Акацуки. В которой назрел раскол, в пучине миссий и поисков джинчуриков в нутрии организации произошёл накал страстей, причём от тех, от кого этого не ожидали. Итачи влюбившись, в шпионку организации Хошиго Сайюри и не в силах вынести её утрату покидает организацию, поклявшись отомстить Пейну и посвятить остаток жизни «искоренению»  зла. Но за ним, увивается Дедайра, узнав о его планах и обосновавшись в «скрытой траве» они образуют новую организацию, под названием «Закат». К которой постепенно стали присоединяться шиноби.
В остальном же мире шиноби было довольно спокойно и мирно, пока
Не стало известно о похищении четырёхвостого, каге камня просит созвать совет пяти, но на него не приходит Мизукаге. В добавок  в воздухе не запахло новой охотой Акацук, которые  после удачного захвата четырёхвостого и пятихвостого, решили нанести удар ещё по четверым одновременно. Так получилось, что в «Облаке» оказалось сразу два джинчурики восьмихвостый и двухвостая, если о первом Облако умолчало, то о второй стало известно Конохе и та отправляет в поддержку отряд шиноби. Второй же удар Акацуки решили направить на Суну и та тщательно готовиться ко вторжению, но Казекаге решает обезопасить деревню и перебирается на время в Коноху. Ну а третий удар пал на саму Коноху. Там укрепляются посты и повышается бдительность. Чётвёртый удар нацелен на водопад.
В Кири место Мизукаге занимает Забуза, но он лишь марионетка Пейна, которая не делает и вздоха без его воли.
Саске же решает, что ему больше нечему учиться у Орочимару и покидает «звук» в поисках Итачи. Но так не знает где его искать, то отправляется в скрытый «водопад», зная, что там находиться треххвостый в надежде, на то Акацуки явяться туда. Но достигнув деревни он застаёт Акацук в ожесточённой схватке с членами другой организации(заката). Наблюдая за боем, он решает вступить в ряды «Заката» но прийдя в штаб он обнаруживает, что глава Заката Итачи конфликт неизбежен.

Скоро будут добавлены квесты